医学部青年教师陈家杰成功绘制出染色体级别的粉尘螨基因组图谱

来源: 发布时间:2021-10-12 13:38:08 浏览次数: 【字体:

近日,深圳大学医学部基础医学院青年教师陈家杰以第一作者身份世界过敏组织(The World Allergy Organization,WAO)举办的学术期刊The World Allergy Organization Journal (影响因子4.084,中科院分区医学2类)在线发表论文,题目为Chromosome-level assembly of Dermatophagoides farinae genome and transcriptome reveals two novel allergens Derf37 and Derf39。该研究由深圳大学医学部吉坤美教授课题组、北京协和医院孙劲旅教授和深圳易码生物科技公司李江团队合作完成。深圳大学为第一署名单位。世界变态反应组织(WAO)成员来自104个地区和国家的变态反应学和临床免疫学协会,为全球近100个国家和地区的会员提供变态反应学相关的医学教育推广计划、专题讨论会和学术讲座;WAO是本学科领域权威国际组织。

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过敏性疾病是一类常见病和多发病。我国目前至少有500万以上儿童患过敏性哮喘、5000万以上过敏性鼻炎患者和3000万以上过敏性皮炎患者;全球过敏性疾病发病率和死亡率正逐年上升。其中,尘螨过敏患者超过50%。尘螨脱敏治疗是目前公认的唯一针对尘螨过敏病因的治疗方法。该研究联合采用了NGS、PacBio和Nanopore三种测序技术,并最大限度去除粉尘螨体内微生物基因组污染,成功绘制出第一个粉尘螨基因组和转录精细图谱,达到染色体水平。该研究为国内外变态反应学研究同行深入研究尘螨过敏提供学术基础,也为研制我国本地化的尘螨脱敏疫苗和诊断试剂奠定了技术基础。此外,该研究还发现了粉尘螨新过敏原Derf37和Derf39,并获得世界卫生组织与国际免疫联合会下属的过敏原国际命名委员会(WHO/IUIS)正式命名。Derf39是迄今为止粉尘螨过敏原组分被WHO/IUIS正式编号排序最新的一个。深圳大学为唯单位完成了上述两个过敏原国际命名。

该研究获得了国家自然科学基金(No.81571570、No.82071806)资助。

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