2021年10月25日，高等教育评价专业机构软科正式发布“2021软科中国最好学科排名”，医学部的基础医学学科、生物医学工程学科均进入全国同类学科的前20%方阵。基础医学比2020年提升12个名次至第21名，生物医学工程提升6个名次至第12名，两个学科都是排名前40%方阵中进步最快的。深圳大学医学部是深圳市首家医学院校，经过13年的发展已在全国范围崭露头角，其中，基础医学学科于2016年获批一级学科硕士授权点，为排名前20%中唯一未取得一级学科博士点的学科。医学部将继续保持强劲的发展势头，争取在“十四五”期间冲击“世界一流学科”。

排名榜单包括96个一级学科，各个学科排名的对象是在该一级学科设有学术型研究生学位授权点的所有高校，发布的是在该学科排名前50%的高校。共有486所高校的4992个学科点上榜。软科中国最好学科排名的指标体系包括人才培养、科研项目、成果获奖、学术论文、学术人才五个指标类别，下设17个指标维度，共计50余项反映学科竞争力的客观量化指标，涉及百余项观测变量。排名数据全部来自第三方数据源，如教育部、科技部、国家自然科学基金委员会、国际和国内文献数据库等。