2022年9月21日，高等教育评价专业机构软科正式发布“2022软科中国最好学科排名”，医学部基础医学学科较2021年提升9个名次至第12名，首次进入全国前11%，位列全国年轻医学院校之首，距前10%仅一步之遥；并且是深圳大学上榜的自然科学学科中排名提升最多的，也是排名前20%方阵中进步最快的，标志着医学部学科高峰建设成效显著。医学部于2016年获批基础医学一级学科硕士授权点。同时，医学部生物医学工程学科位列全国第14名，进入前20%方阵。

医学部将继续保持强劲的发展势头，以学科建设为龙头，集中优势力量将基础医学和生物医学工程两个优势学科持续做大做强，争取在“十四五”期间冲击“世界一流学科”。到2035年，争取建成国内领先、国际知名，医、教、研、产业化一体化发展的医学院校，为建设“健康中国”深圳样板提供强有力支撑。